ProstituéeToolkit d'annotation de résidus de protéines | |
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Prostituée Classement & Résumé
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- Licence:
- Freeware
- Nom de l'éditeur:
- Huzefa Rangwala
- Systèmes d'exploitation:
- Windows All
- Taille du fichier:
- 363 KB
Prostituée Mots clés
- annotation Plug-in d'annotation Annotation SDK Annotation ActiveX protéine annotation vidéo récupérer des protéines Analyser la protéine comparer la protéine Annotation PDF Annotation géométrique annotation sémantique Annotation de graphique molécule de protéine bibliothèque d'annotation Processeur d'annotation Annotation d'image Annotation de cohésion lexicale Annotation semi-automatisée auditeur d'annotation Annotation reseéquision Débogage Symbole Annotation annotation cli Texte d'annotation créer une annotation Identification des protéines Synthétiseur des protéines cristallisation de protéines translocation des protéines liste de protéines Visualisation des protéines Annotation de séquence Outil d'annotation Numéro d'annotation annotation ruby Annotation du site Voir l'annotation extraction de protéines processus d'annotation transcription Annotation Raffinement des structures de protéines structure de protéines Caractéristiques de la protéine géométrique Annotation chromosomique Annotation des gènes Annotation d'image Annotation de dosage Attribuer une annotation annotation de code annotation audio Valudation de protéines réglementées Valider la protéine régulée Visionneuse de protéines résidus quadratique Quadratique non résidu résidu Moins de résidus non quadratique annotation du discours annotation mappeuse Analyseur d'annotation Annotation intuitive Analyser la base de données des protéines Evolution de protéines Test de protéines Annotation de dessin dichroïsme de protéines Structures de protéines annotation de données annotation basée sur l'ontologie Résidus de protéines Résidus aminoacide Constructeur SVM Annotation fonctionnelle Système d'annotation d'ADNc Évaluer le complexe de protéines Prédiction complexe des protéines Voir le complexe de protéines Pourcentage de résidus résidus d'acides aminés Navigateur de protéines Préparer une annotation de structure Banque de données de protéines de Brookhaven éditeur d'annotation voir les protéines Voir le fichier de protéines Analyseur de protéines Annotation du vent Afficher l'annotation faire une annotation placer l'annotation Annotation de la carte contrôle d'annotation Voir les séquences de protéines Visionneuse de séquences protéiques annotation nucléotidique simuler l'évolution des protéines Simulation de l'évolution des protéines aligner la protéine Visualiser la protéine Protéine mascotte Annotation de pointe Interaction protéique protéine de rendu Afficher les fichiers de protéines gérer la banque de données protéique Vizualiseur de protéines Structure de la protéine 3D suppression d'annotations annotation kodak comment jouer Xharbour ActiveX XLS à DTD DivX Codec Linux contrôleur vidéo Toshiba chansons de karaoké pour non libère 7.00.020.3172 Étiquette de CD de ZweckForm autocad 2008 vers le bas ISO R773 PDF
Prostituée La description
La boîte à outils Prosat a été développée pour être un ensemble de programmes permettant de créer des modèles basés sur SVM pour annoter les résidus d'acides aminés dans des séquences protéiques à l'aide de fonctionnalités fournies par l'utilisateur (comme des profils PSI-BLAST ou des profils PSIPRED). En particulier, la boîte à outils construit des fonctionnalités à l'aide d'une fenêtre autour du résidu et est équipée d'une fonction de noyau spécialisé (fonction de noyau exponentielle de seconde commande normalisée NSOE) ainsi que la fonction standard de noyau SVM. prosat_learn est le programme d'apprentissage "N" modèles de classification à un point de repos, où n sont le nombre possible d'annotations. Il peut également apprendre un modèle de régression de vecteur de support pour prédire une valeur de point flottante. usage Prosat_learn prosat_predict est le programme permettant de prédire l'annotation pour chaque résidu des modèles construits et de produire un profil de dimension L xn, émettant le score de chacun des n un-par rapport à Les modèles SVM de repos pour chaque résidu d'acide aminé et L est la longueur de la séquence protéique. En cas de modèle de régression, n = 1. usage Prosat_predict entrée Prosat_predict a trois paramètres requis: - Fichier de test: Le fichier de test fournit la liste des fonctionnalités de séquence pour lesquelles nous devons prédire les profils d'annotation. Il est similaire au fichier d'entrée utilisé dans prosat_learn, sauf qu'il ne contient pas les noms des fichiers d'annotation vraies, car nous prédisons la même chose. - Fichier de modèle: Le fichier de modèle est le fichier de modèle émis par Prosat_Learn - Fichier de prédiction: le fichier de prédiction fournit le chemin d'accès et le préfixe des prévisions de sortie sous forme de profils d'annotation. sortie La sortie consiste en un ensemble d'annotations et de profils prédits, qui ne sont que les prévisions SVM de chacun des modèles SVM «Num Element».
Prostituée Logiciels associés
Extracteur de fichier peptidique
extrait les informations peptidiques des fichiers séquestres ...
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