Simdiv

Générez des ensembles de données sous une isolation avec modèle de migration
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Simdiv Classement & Résumé

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  • Rating:
  • Licence:
  • Freeware
  • Nom de l'éditeur:
  • Jody Hey
  • Systèmes d'exploitation:
  • Windows All
  • Taille du fichier:
  • 103 KB

Simdiv Mots clés


Simdiv La description

SIMDIV a été développé pour être un programme pouvant être utilisé dans le laboratoire hey pour générer des ensembles de données sous une isolation avec le modèle de migration. Il peut être utilisé pour plusieurs populations pour une variété de modèles de mutation - à peu près pour tout type d'ensemble de données pour lequel des programmes IM et des programmes connexes peuvent être utilisés. SIMDIV n'est pas le seul programme qui peut faire cela. Il y a beaucoup d'autres simulateurs de Coalescents, et une personne que je connaisse peut être utilisée pour l'isolement avec les modèles de migration est Simcoal, mais il peut y avoir d'autres. SIMDIV simulera des données avec une recombinaison si les utilisateurs précisent, même si des programmes de messagerie instantanés n'assument aucune recombinaison. Le programme peut gérer jusqu'à 10 populations, avec 350 copies de gènes par locus, pour un nombre quelconque de LOCI. Si vous le souhaitez un utilisateur peut charger toutes les spécificités associées à un ensemble de données réel (# LOCI, tailles d'échantillonnage, modèles de mutation et estimations des paramètres de messagerie instantanée) afin que les résultats de l'IM / SIMDIV puissent être comparés aux données réelles utilisées pour générer le estimations de paramètres. Pour les utilisateurs de messagerie instantanée, SIMDIV devrait être assez facile à utiliser car les paramètres signifient les mêmes choses et sont mis à l'échelle de la même manière dans SIMDIV et les programmes de messagerie instantanée.


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