Mrmodelest

C Programme de sélection de modèles de substitution de l'ADN en utilisant Paup
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Mrmodelest Classement & Résumé

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  • Rating:
  • Licence:
  • GPL
  • Nom de l'éditeur:
  • Johan Nylander
  • Systèmes d'exploitation:
  • Windows All
  • Taille du fichier:
  • 461 KB

Mrmodelest Mots clés


Mrmodelest La description

La comparaison de différents modèles d'ADN Evolution est une tâche réservée à un ensemble particulier d'utilisateurs, qui disposent des connaissances nécessaires pour extraire des informations utiles. Ils ont également besoin d'outils spécifiques pour effectuer l'opération et MRMODELTEST est un utilitaire spécialement conçu pour la demande d'emploi de la commande. Cela pourrait distancer une partie de l'utilisateur de celui-ci, bien que la fois lancée, elle présente les instructions appropriées sur l'utilisation de celui-ci et des commandes et des arguments pris en charge. Le développeur informe que l'outil utilise des tests de variation de vraisemblance et de l'AIC (critère d'informations AKAIKE), qui mesure une qualité relative d'un modèle statistique pour des données spécifiques. Détails supplémentaires fournis par le développeur Reportez-vous à la quantité de modèles de substitution nucléotidique prise en charge par l'application, qui est définie sur 24, et toutes peuvent être spécifiées dans l'outil MRBAYES (utilisé pour l'estimation bayésienne de la phylogénie). Liste des Commandes prises en charge d'une interface utilisateur graphique, travaillant avec MRModelTest peut ne pas être trop difficile pour les utilisateurs qu'il s'agit, car la fenêtre de la console affiche la liste des commandes prises en charge. Le programme permet de sélectionner la hiérarchie HLRT2 / 3/4 ainsi que de définir les niveaux alpha et débogage. Des exemples sont présentés à l'écran pour faciliter les choses. Il est également possible d'activer l'AIC ou le mode calculateur LRT et définir le nombre de taxons. Pour la plupart des opérations, des info-bulles supplémentaires peuvent aider l'utilisateur. Comparez l'ADN Evolution ModelsMrmodeltest est une fourchette de l'application ModelTest qui prend en charge près de deux fois le nombre de modèles de substitution de nucléotides. Mais son avantage est que ceux-ci peuvent être mis en uvre dans l'utilité MRBAYES pour l'estimation de la phylogénie. Avis écrit par Ionut Ilascu, dernière mise à jour le 2 juin 2014


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