Seq-gen simule l'évolution des séquences de nucléotide ou d'acides aminés
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Seq-gen Classement & Résumé

Seq-gen Mots clés

simulateur séquence acide Titrage acide proportion de nucléotides police acide code clé Transaction acide Analyse de l'acide nucléique séquence nucléotidique Directeur de la séquence nucléotidique nucléotide simuler l'évolution Trouver l'acide aminé Finder d'acides aminés rechercher un acide aminé Analyseur d'acides aminés Séquence d'acides aminés acide aminé Traducteur d'acide aminé thème acide extraire l'acide aminé solution acide résidus d'acides aminés acide aminé optimal Modèle de substitution nucléotide motif de nucléotide Séquence d'acide nucléique Substitution de nucléotide annotation nucléotidique alignements de nucléotide Analyser l'acide aminé acide nucléique analyser la paire d'acides aminés Analyse des paires d'acides aminés Analyse de séquence d'acides aminés Analyser la séquence d'acides aminés Classification des acides aminés Topologie d'acides aminés simulateur d'évaluation Détecteur d'acides amino détecter l'acide amino-acide polymorphismes nucléotides mutation nucléotidique fraction nucléotidique Analyser la chaîne d'acides aminés boucles acides Transactions acides cracker de mot de passe hotmail pro acide acide pro 7 jeux demande Machine anglaise en Albanie bulles en ligne Imprimante jet d'encre C3125 Message de texte mobile AIM PRO pour eau séquentielle Glock 26 Gen Transformar iso em carte de crédit gen Examens de la pratique du soleil Umd Gen

Seq-gen La description

SEQ-Gen a été développé pour être un programme qui simulera l'évolution des séquences de nucléotides ou d'acides aminés le long d'une phylogénie, en utilisant des modèles communs du processus de substitution. Une gamme de modèles d'évolution moléculaire sont implémentées, y compris le modèle général réversible. Les fréquences d'état et autres paramètres du modèle peuvent être données et l'hétérogénéité des taux spécifique au site peut également être incorporée de différentes manières. Tout nombre d'arbres peut être lu et le programme produira n'importe quel nombre de jeux de données pour chaque arborescence. Ainsi, de grands ensembles de simulations répliquées peuvent être facilement créés. Il a été conçu pour être un simulateur à usage général qui intègre la plupart des modèles couramment utilisés (et compatibles de manière compatible) d'évolution de la séquence moléculaire. SEQ-GEN est un programme contrôlé de ligne de commande écrit dans ANSI C. Il doit être facilement compilé et exécuté sur n'importe quel système UNIX ou poste de travail. Cet article décrit l'utilisation de SEQ-GEN sur une machine UNIX. L'application nécessite une quantité de mémoire proportionnelle à la taille de chaque ensemble de données de séquence simulée. courir SEQ-GEN Pour exécuter SEQ-GEN, vous tapez: SEQ-GEN <> Lorsque sont les paramètres du programme (décrit ci-dessous), est le fichier d'arborescence et est le nom du fichier contenant les séquences simulées. Le fichier d'arborescence doit contenir un ou plusieurs arbres au format Phylip. Les séquences produites par SEQ-Gen sont écrites sur la sortie standard (et peuvent ainsi redirigemment redirigé vers le fichier de sortie en utilisant> ). D'autres informations et résultats sont écrits dans l'erreur standard et apparaîtront donc à l'écran.

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