Oslay correspondance de séquence facilitée.
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Oslay Classement & Résumé

Oslay Mots clés

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Oslay La description

Oslay est un logiciel pratique conçu pour utiliser la syntheny entre séquences assorties dans un ensemble cible et un ensemble de référence pour mettre en place les contigranes (ou les échafaudages) de l'ensemble cible. L'outil fournit une visualisation interactive de la disposition calculée et le résultat peut être importé dans l'outil d'édition d'assemblage consé à prendre en charge la conception des paires d'amorces pour la fermeture d'écart. Remarque: libre à des fins académiques. Caractéristiques principales: lit deux fichiers FASTA (contigutions d'assemblage de cible et de séquence de référence / assemblage / assemblage) et d'un fichier explosion / nuceuse est capable de trier et de commander des deux axes simultanément si des assemblages de cible et de référence sont des assemblages inachevés est applicable aux génomes procaryotes et eucaryotes a plusieurs possibilités de filtrer et d'adapter des données telles que la rupture des extrémités de la contig, filtrant des hits de souffle, ... Les exportations ont des résultats des résultats sur plusieurs formats graphiques (.jpg, .gif, .eps, .png et .svg.) modifie ou génère un nouveau fichier ACE directement importable dans la conception de l'apprêt simplifié fournit des fonctionnalités de zoom utiles facilite l'analyse visuelle des assemblages et des méta-assemblages par exemple. Objectifs de recombinations ou de moulages respectivement.

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