jmotu analyse des données de séquence d'ADN de code à barres facilitée.
Télécharger maintenant

jmotu Classement & Résumé

jmotu Mots clés

Analyse Analyser Lire Séquence d'ADN Analyse de l'ADN Convertir la séquence d'ADN Analyse d'ADN d'étirement Lire la séquence d'ADN Lecteur de séquence d'ADN Analyser la séquence d'ADN Modifier la séquence d'ADN Éditeur de séquence d'ADN Voir la séquence d'ADN Analyse de séquence d'ADN Voir les données de l'ADN Afficher les données ADN Données d'ADN Données d'alignement de la séquence séquence de données Analyseur de séquence d'ADN Aligner la séquence d'ADN Comparez la séquence d'ADN Analyse du jeu de données de l'ADN Données d'empreintes digitales ADN Manipulation de la séquence d'ADN Données de séquence d'ADN alignée Séquence d'ADN génomique Visionneuse de données de séquence Convertir des données d'ADN Visualisation de la séquence de données compresser la séquence d'ADN Compression de séquence d'ADN Encodé la séquence d'ADN Compresseur de séquence d'ADN Analyse de la séquence de base de données Données de séquence d'ADN Lire les séquences d'entrée Données de séquence de recherche Recherche de données de séquence Analyse des données de séquence Analyser les données de séquence d'ADN Analyse des données de séquence d'ADN Analyser la séquence d'ADN Voir les données de méthylation de l'ADN Voir les données de séquence Analyser les données de séquence Analyseur de données de séquence Analyse de fichier séquence Analyser les données de séquence données de séquence Analyse de méthylation de l'ADN Visualisation de la séquence d'ADN contrôle des données de séquence Analyse de séquence multiple Évolution de la séquence d'ADN Analyse de restriction de l'ADN

jmotu La description

JMOTU est un package pratique et facile à utiliser spécialement conçu pour vous aider à cluster des données de séquence d'ADN de code à barres dans des unités taxonomiques opérationnelles moléculaires (Motu). Si vous n'êtes pas sûr de ce qu'est une motu, veuillez consulter les pages de codes à barres ADN sur notre site Web. JMOTU fait ce qui suit: · Lit les séquences d'entrée au format FASTA ou NEXUS · Calcule les distances entre paires de séquences à l'aide d'une combinaison d'explosion et de l'algorithme d'alignement global exact de la gruchouette · Grappes de séquences d'entrée dans Motu en utilisant diverses mesures de coupure JMOTU peut traiter de grands ensembles de données et utilise une série d'étapes de filtrage pour minimiser le nombre d'alignements globaux exacts qui doivent être effectués. Lors du calcul des distances paires, JMOTU ignore les lacunes et ne comptent que des erreurs de nucléotides, ce qui le rend relativement robuste pour séquencer des erreurs causées par des exécutions d'homopolymère. Le regroupement est effectué à l'aide d'un algorithme gourmand qui n'est pas dépendant de l'ordre de séquence d'intrants. JMOTU a été testé sur des ensembles de données brutes d'environ 50000 séquences d'entrée et peut en grapper des ensembles de données plus importants en préformant la précontrainte des sous-ensembles de données avant de les combiner pour une analyse globale.

jmotu Logiciels associés