Taxonnerator

L'analyse de données de la séquence de code à barres en cluster est facile.
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Taxonnerator Classement & Résumé

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  • Rating:
  • Licence:
  • Freeware
  • Nom de l'éditeur:
  • Mark Blaxter
  • Taille du fichier:
  • 5 MB

Taxonnerator Mots clés


Taxonnerator La description

Le taxonnerator est un package pratique et facile à utiliser conçu pour vous aider à effectuer une annotation simple à base de similarité de données de séquence de code à barres en cluster produites par JMOTU. Il génère une annotation taxonomique pour MOTU par des séquences représentatives de dynamitage contre une base de données préformatée de séquences d'organismes connus (disponible sur ce site). Le taxonnerator est utile pour une enquête taxonomique initiale sur les jeux de données de codes à barres environnementaux. Pour chaque séquence de base de données montrant une similitude significative à une motu, des informations taxonomiques sont stockées à tous les niveaux taxonomiques. Cela permet à l'utilisateur final d'enquêter sur la distribution taxonomique des séquences d'échantillons à plusieurs niveaux. Les données étant stockées dans une base de données relationnelle, elles peuvent être interrogées à l'aide de la langue de requête structurée (SQL) de manière très flexible, ou écrite dans des fichiers de sortie pour une analyse plus poussée.


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