Grazzy en cluster Un outil de clustering pour les données de micro-carie
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Grazzy en cluster Classement & Résumé

Grazzy en cluster Mots clés

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Grazzy en cluster La description

L'application de clustering Fuzzy a été développée pour être un programme qui utilise une combinaison de la méthode d'algorithme génétique et de C-moyen pour le regroupement de données de données de micropuissures et de la matrice de distance. Format de fichier d'entrée :: - Ce programme utilise un fichier texte brut en entrée. - Tous les éléments de données doivent être séparés par des tabulateurs. - Aucune valeur manquante n'est autorisée. Microarray: - La première ligne contient des noms de toutes les colonnes. - Chaque ligne (commençant par seconde) doit avoir le nom de gène (1 colonne ou plus) et les valeurs d'expression pour chaque condition. Matrice de distance: - La première ligne contient une légende (mot unique ou une chaîne dans la 1ère position) et noms d'éléments - Chaque ligne (commençant par la seconde) doit contenir le nom de l'élément (le même, comme dans la colonne correspondante) et les valeurs des distances entre cet élément et les autres. - Matrix est symétrique. - Toutes les valeurs sont normalisées (pas supérieures à 1,0). - Remarque: la matrice de similarité est également autorisée. Format de fichier de sortie: - Paramètres de l'algorithme - distribution de gènes en grappes (si l'adhésion est> 1 / numéroflusters) - Matrice d'adhésion pour tous les gènes - Coordonnées des centres de clusters (dans les unités d'expression génique)

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