Chiat

génère des parcelles de variation sage-sage le long d'un alignement de séquence
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Chiat Classement & Résumé

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  • Rating:
  • Licence:
  • GPL
  • Nom de l'éditeur:
  • Joe Parker
  • Systèmes d'exploitation:
  • Windows All
  • Taille du fichier:
  • 995 KB

Chiat Mots clés


Chiat La description

Le nom Shiat représente une hétérogénéité de Shannon dans l'outil Alignements. Shiat génère des parcelles de variation sage-sage le long d'un alignement de la séquence (y compris les mesures de distance de shannon et de distance de halling). Cette application fournit une interface graphique intuitive pour le calcul simultané de trois mesures de variation du site dans les alignements de l'ADN ou de l'ARN. L'indice d'information de Shannon, la distance Hamming et (fréquence de consensus) sont tous calculés et affichés dans une série de parcelles graphiques. Les alignements multiples peuvent être importés et comparés, et un panneau de vue de données permet une copie facile-et-colle dans des applications externes. Quatre mesures sont mises en uvre: - entropie d'informations Shannon (par position) - 1- (fréquence de consensus) (par position) - 1- (Index hétérozygoty H) (par position) - Distance de Hamming (Summated Pairise à travers l'alignement)


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