Hapevolution

détecte les interactions Gene-Gene des données haplotypes de cash-contrôle
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Hapevolution Classement & Résumé

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  • Rating:
  • Licence:
  • Freeware
  • Nom de l'éditeur:
  • Memorial University of Newfoundland
  • Systèmes d'exploitation:
  • Windows All
  • Taille du fichier:
  • 1.6 MB

Hapevolution Mots clés


Hapevolution La description

Les maladies complexes impliquent plusieurs gènes à faible pénétration pouvant être distribuées sur le génome. La plupart des méthodes actuelles de l'association haplotype sont généralement limitées de longueur et sont constituées d'allèles de SNP contiguës. Ces approches ont une capacité limitée pour détecter l'épistasie de multiples interactions gènes-gènes. Des preuves récentes ont montré que la structure 3D de chromosomes peut jouer un rôle dans la mesure où les SNPs d'interagir avec des éléments génétiques physiquement séparés par une grande distance. Hapevolution est une application professionnelle conçue pour mettre en place un algorithme coopératif covolutive (CCA) pour détecter les interactions gène-gène des données haplotype de cas-la case; De plus, cet algorithme peut tolérer jusqu'à 15% de positions manquantes / ambiguës dans les données haplotypes résultant de la phase de haplotype de génotypes. En outre, l'algorithme peut calculer des associations épistatiques à partir de gènes s'étendant sur plusieurs chromosomes.


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