La matrice de séquence est une petite application simple et facile à utiliser conçue pour faciliter l'assemblage de matrices de données phylogénétiques avec plusieurs gènes. Les fichiers pour les gènes individuels sont déplacés et déposés dans une fenêtre et les séquences sont concaténées. Une table donne une vue d'ensemble sur la quantité d'informations de séquence disponibles pour les différents gènes et espèces. L'utilisateur peut demander à la matrice de séquence générer une grande variété de jeux de caractères et de taxon, par exemple un taxon défini avec toutes les espèces ayant plus d'un nombre spécifié de gènes ou de base. Les séquences concaténées peuvent être exportées dans le format NEXUS ou TNT. Les séquences individuelles peuvent être exclues d'être exportées.
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