msatcommander localiser les répétitions microsatellites, concevoir des amorces spécifiques à locus et les étiqueter
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répéter conception d'apprêt apprêt répétitions biologiques ADN microsatellite Microsatellite Répéter Finder étiquette microsatellite Maladie Locus de sensibilité Grand jeu de données microsatellite Analyseur de microsatellite trouver des répétitions tandem imbriquées trouver des marqueurs microsatellites Marqueurs Microsatellite Finder amorce de conception Détecter les répétitions de l'ADN Détection de répétition de l'ADN

msatcommander La description

MSATCOMMANDER est un programme Python écrit pour localiser les répétitions MicroSatellite (SSR, VNTR, C) dans la séquence FASTA-formatée ou des fichiers de consensus. Msatfinder recherchera toutes les répétitions Di-, Tetro, Tetra-, Penta et Hexa-Nucletide (avec des options pour rechercher moins de types de répétition et de combinaisons de types de répétition). Donnez à MSATCOMMANDER un essai d'évaluer pleinement ses capacités! Caractéristiques principales: recherche tous les répétitions mono-, di-, tri-, tétra-, penta et hexanucléotides Les répétitions peuvent être combinées sur des distances (BP) spécifiées par l'utilisateur (BP). conçoit des amorces pour les répétitions localisées Tags et teste les amorces avec M13R, CAG ou Tag personnalisée. Le "meilleur" amorce est rapporté à l'utilisateur ajoute des pigtails GTTT au "meilleur" amorce signalé à l'utilisateur offre une interface graphique pratique pour une majorité d'utilisateurs Sorties entraîne un format CSV, pour une importation facile au logiciel de feuille de calcul

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