Ontomine Onomine est un logiciel d'exploration de données utilisée pour l'exploitation moléculaire automatisée pour la bioactivité, la toxicité et la prévision des effets secondaires. L'Ontomine est basé sur des propriétés déterminées expérimentalement d'environ 100,0
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Ontomine Classement & Résumé

Ontomine Mots clés

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Ontomine La description

Un logiciel d'exploration de données utilisée pour l'exploitation minière moléculaire automatisée pour la bioactivité L'Ontomine est un logiciel d'exploration de données utilisée pour l'exploitation moléculaire automatisée pour la bioactivité, la toxicité et la prévision des effets secondaires. L'Ontomine est basé sur des propriétés déterminées expérimentalement provenant d'environ 100000 diverses molécules diverses, collectées à partir de bases de données, d'encyclopédies et d'autres littératures suivies de la commission des mains expert. Cet ensemble de données est formulé en arbres hiérarchiques composés de plusieurs milliers de classes de bioactivités, d'objectifs de médicaments, de zones thérapeutiques, d'effets indésirables et de toxicités. Chaque classe est représentée par une empreinte digitale pour les molécules connexes pour leurs propriétés moléculaires, telles que la présence / l'absence / le nombre de chaînes latérales / activités chimiques, des structures d'anneaux, etc. Ontomine et comparaison avec d'autres méthodes existantes D'autres approches de prédiction de bioactivité actuellement utilisées peuvent être classées en trois catégories: * Graphique théorique et sous-structure, descripteurs chimiques topologiques et physicochimiques * Méthodes de sous-structures ordinaires maximales, similaires d'empreintes digitales et méthodes d'apprentissage automatique * Méthodes de voisinage Atom Toutefois, ces méthodes sont actuellement limitées par des facteurs tels que la dépendance des métriques à distance, les coupures ne sont pas représentatives de l'activité, difficiles à créer des modèles QSAR à plusieurs niveaux différents, par exemple. Cibles de médicaments, processus biologiques et zone thérapeutique ainsi que l'interprétation des résultats. Ontomine (US breveté) est alternative à ces méthodes, transformant les informations structurelles pour des molécules liées à chimiquement, biologiquement ou pharmacologiquement à un schéma hiérarchique de concepts et de descripteurs. L'Ontomine découvre des modèles dans le schéma associé et prédit l'activité biologique, l'utilisation de règles déduites d'analyser les schémas. L'un des avantages significatifs des algorithmes de l'ontomine est qu'ils permettent d'activer l'échafaudage, car l'échafaudage de base n'est pas conservée lorsque des schémas caractéristiques d'une activité sont découverts. Les modèles d'ontomine représentent des conditions "nécessaires mais pas suffisantes" pour la bioactivité indépendamment d'un échafaudage. Le saut d'échafaudage explicite peut être effectué en générant des isomères constitutionnels et en sélectionnant des molécules intéressantes à l'aide de la base de règles. Les résultats de l'Ontomine sont présentés comme des modèles compréhensibles simples représentatifs de l'activité. De plus, les prévisions de l'ontomine sont évolutives pour des millions de molécules. De plus, les jeux de données Ontomine curated peuvent être ajoutés avec des jeux de données internes des activités de molécule mesurées des collections de composé interne.

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