Sander 8 Commandes d'emploi Préparation du fichier de contrôle du travail pour Sander-8
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Sander 8 Commandes d'emploi Classement & Résumé

Sander 8 Commandes d'emploi Mots clés

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Sander 8 Commandes d'emploi La description

Sander est le module ambré qui effectue une minimisation d'énergie, une dynamique moléculaire et des raffinements de RMN. L'acronyme signifie recuit simulé avec des retenues énergétiques dérivées de la RMN, mais ce module est utilisé pour une variété de simulations qui n'ont rien à voir avec le raffinement de RMN. Sander utilise des namelistes pour contrôler ses paramètres de minimisation générale et de dynamique. Namelist fournit une entrée dirigée par la liste et spécification pratique des valeurs par défaut. Sander 8 Les contrôles de travail sont un programme Java écrit pour faciliter la préparation des fichiers de contrôle des travaux d'entrée pour Sander-8. Il utilise des commandes intuitives pour configurer les variables de contrôle des travaux pour Sander Run. Dans de nombreux cas, au lieu de la variable, il utilise la description de la variable. Par exemple, pour une variable NSTLIM, il utilise "nombre d'étapes MD (NSTLIM)".

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