Logobar est un logiciel pratique et facile à utiliser spécialement conçu pour vous aider à voir les logos de séquence protéique. Avec cette application, vous pouvez générer des logos de séquence de protéines à partir de plusieurs alignements de séquence sur votre propre ordinateur et vous obtiendrez un fichier de sortie supplémentaire indiquant l'incidence des acides aminés à chaque position de l'alignement de la séquence multiple. Caractéristiques principales: La fréquence des résidus à des positions particulières est représentée avec des barres de couleur. Les acides aminés peuvent être placés en groupes (par exemple, avoir des acides aminés similaires dans le même groupe) selon les utilisateurs de choix. Les barres peuvent être triées en fonction des groupes, de manière à ce que les acides aminés similaires soient placés ensemble dans le graphique à barres. Les lacunes sont prises en compte et également affichées dans le logo. Les modifications des paramètres sur un alignement de séquence multiple chargé sont visualisées rapidement car Logobar est une application Java exécutée sur votre ordinateur local.
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