GCUA: Analyse générale de l'utilisation du codon

Analyse des gènes Facile.
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GCUA: Analyse générale de l'utilisation du codon Classement & Résumé

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  • Rating:
  • Licence:
  • Freeware
  • Nom de l'éditeur:
  • James O. McInerney
  • Systèmes d'exploitation:
  • Windows All
  • Taille du fichier:
  • 82 KB

GCUA: Analyse générale de l'utilisation du codon Mots clés


GCUA: Analyse générale de l'utilisation du codon La description

GCUA: L'analyse d'utilisation du codon général est une application basée sur Java pratique, facile à utiliser, spécialement conçue pour effectuer diverses tâches d'utilisation pour évaluer l'utilisation du codon dans un ensemble de gènes. Vous pouvez l'obtenir de faire des choses simples comme calculer le nombre d'observations d'un codon particulier dans un gène. Ou vous pouvez faire la même chose pour le jeu de données combiné. Vous pouvez également consulter les fréquences d'utilisation des acides aminés (à nouveau pour chaque gène ou pour le jeu de données dans son ensemble). Le programme produit également une matrice de distance basée sur la similitude de l'utilisation du codon dans les gènes. Toutefois, la caractéristique la plus importante du programme est sa capacité à utiliser une analyse multivariée pour examiner la variation de l'utilisation du codon parmi les gènes. Bien qu'il soit populaire de dire qu'un organisme a une usage de codon particulier, il est maintenant connu qu'un organisme des gènes pourrait avoir plus d'un modèle d'utilisation du codon et qu'il n'utilise généralement que par une méthode d'analyse multivariée qu'il est possible de déterminer les types de variation contenue dans les données.


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