Fpg simule une population de taille constante
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Fpg Classement & Résumé

Fpg Mots clés

simulation simuler simulateur croix constante volume constant signal constant constant mutation de la population population afficher la population population mondiale Afficheur mondial de la population contre la population population Horloge Estimation de la population vérificateur de population popups constants valeur constante Nom Constant Lister Liste Nom constant Nom constant Évolution de la génétique de la population Répartition de la population Calculatrice constante Génétique de la population Simuler le goulot d'étranglement de la population Goulot détranglement démographique Évaluez la constante constante simulateur génétique des populations Simulateur de population Les dynamiques de population moniteur de population Inhibition constante déterminer la constante Population autotétraploïde simuler une accélération constante mélange de population estimer les paramètres de la population Taille efficace de la population Structure génétique de la population simuler la population simulation de population population démographique population génétique Définir des groupes de population groupe de population population haploïde stratification de la population analyser la population Analyse de la population Simulation génétique de la population constante de dissociation

Fpg La description

Le nom FPG signifie la simulation génétique de la population en avant. La FPG simule une population de taille constante qui suit divers procédés évolutifs, notamment: la mutation, la recombinaison, la sélection naturelle et la migration. Le sens de "avancer" dans ce contexte est simplement que le temps, dans la simulation, se déplace comme dans le monde réel. Cela contraste avec la simulation génétique de la population coalescente dans laquelle le temps représenté dans la simulation est de retour dans le passé. Les simulations coalescentes présentent de nombreux avantages, mais elles sont difficile à manifester s'ils incorporent une sélection naturelle sur plusieurs sites. FPG est utile pour évaluer l'impact de la sélection naturelle sur les modèles de variation génétique. Il est conçu de manière à pouvoir se rapprocher de situations du monde réel avec des tailles de population assez importantes et des taux de mutation élevés sur de longues étendues d'ADN. Le modèle de mutation est un modèle de sites infinis, ce qui signifie qu'aucun site qui sèglent dans la population ne peut recevoir une autre mutation. La simulation peut accueillir des mutations neutres, bénéfiques et délétères sous plusieurs modèles de fitness différents, y compris des modèles additifs, multiplicatifs et épistatiques. Le programme génère une grande variété d'analyses, notamment des niveaux de polymorphisme, de l'hétérozygosité (observé et prévu), des taux de fixation et du déséquilibre de liaison - tous menés pour chacune des nombreuses catégories de mutation. Lorsque la migration est invoquée, plusieurs analyses concernant la structure de la population sont effectuées .. Le cycle de vie de base alterne des génomes haploïdes (gamètes) et génomes diploïdes (Zygotes), et se déroule comme suit: - Les gamètes sont associées au hasard dans des zygotes - La forme physique est mesurée pour chaque zygote en fonction des mutations qu'il porte. Si la dominance est définie sur 0,5, le modèle est similaire à la plupart des égards à un modèle de sélection haploïde. - Le succès de la reproduction est le nombre de gamètes contribuèrent à la prochaine génération et est déterminée pour chaque Zygote en tirant par une distribution multinomiale avec des attentes qui sont les valeurs de remise en forme relatives de chaque classe de fitness. - La recombinaison et la mutation se produisent lors de la production de gamètes - S'il y a plusieurs populations, les gamètes sont tirées au hasard de chaque population et placées au hasard dans d'autres populations. Ces gamètes qui sont déplacées par les migrants sont perdues, la migration ajoute donc un élément supplémentaire de la dérive génétique. C'est un modèle d'île de migration - Les nouveaux zygotes sont formés par une union aléatoire de gamètes. Les générations ne se chevauchent pas.

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