Fastml Un programme de calcul des séquences d'acides aminés ancestrales d'un arbre phylogénétique
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Fastml Classement & Résumé

Fastml Mots clés

séquence acide Visionneuse d'arbres phylogénétiques voir l'arbre phylogénétique Séquence des arbres phylogénétiques Trouver l'acide aminé Finder d'acides aminés rechercher un acide aminé Analyseur d'acides aminés Séquence d'acides aminés acide aminé Traducteur d'acide aminé estimer l'arbre phylogénétique arbre phylogénétique analyser arbre phylogénétique extraire l'acide aminé phylogénétique résidus d'acides aminés acide aminé optimal Groupe de gènes ancestral Gene ancestral éditeur d'arbres phylogénétiques créer un arbre phylogénétique générateur d'arbres phylogénétiques Modifier l'arbre phylogénétique construire un arbre phylogénétique Estimation de l'arborescence phylogénétique Analyser l'acide aminé acide nucléique analyser la paire d'acides aminés Analyse des paires d'acides aminés Analyseur d'arbres phylogénétiques Afficher l'arbre phylogénétique Analyse de séquence d'acides aminés Analyser la séquence d'acides aminés Arbre phylogénétique annoté Classification des acides aminés Topologie d'acides aminés Reconnaître la séquence Détecteur d'acides amino détecter l'acide amino-acide Analyser la chaîne d'acides aminés ancestral

Fastml La description

FastML a été développé pour être un programme de calcul des séquences amino-acides ancestrales d'un arbre phylogénétique. Usage: FastML utilise des indicateurs dans les arguments de la ligne de commande: -Pour aide, tapez "fastml.exe -h" -s seq.aln = le nom du fichier d'entrée de séquence. -t arbre.txt = le nom du fichier d'arborescence d'entrée (nouveauick format). Le programme reconnaît automatiquement l'un de ces formats de séquence: PHYLIP, MOLPHY, FASTA, MASE, CUSTALE, OU NEXUS. Utilisez l'option -m -m pour choisir un modèle. Les modèles suivants sont pris en charge (pour les acides aminés): jour, JTT, Rev, CPREV, WAG, JC. Pour les nucléotides, seul seul le modèle JC est pris en charge. Le modèle par défaut est le JTT.

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