FASTA FICHIER Com comparateur

compare les séquences protéiques de différents fichiers FASTA
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FASTA FICHIER Com comparateur Classement & Résumé

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  • Rating:
  • Nom de l'éditeur:
  • Pacific Northwest National Laboratory
  • Systèmes d'exploitation:
  • Windows All
  • Taille du fichier:
  • 174 KB

FASTA FICHIER Com comparateur Mots clés


FASTA FICHIER Com comparateur La description

Le comparateur FASTA FICHIER est un utilitaire utile conçu pour comparer des parties des séquences protéiques à partir de deux fichiers FASTA et écrire les protéines et les séquences correspondantes à un fichier texte de sortie. L'utilisateur doit spécifier la longueur des résidus à utiliser lors de la comparaison des deux fichiers protéiques. Le fichier de sortie contiendra les noms des protéines avec des résidus communs, les résidus réels en commun et les descriptions de protéines pour chaque protéine (comme la lecture du fichier FASTA). La fonctionnalité de ce programme est une version simpliste de l'algorithme d'explosion où les protéines doivent avoir des régions d'acides aminés identiques (plutôt que d'une homologie similaire, qui est l'intention de l'explosion).


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