Cvit Voir les chromosomes à l'aide de cet outil
Télécharger maintenant

Cvit Classement & Résumé

Cvit Mots clés

téléspectateur voir chromosome séquence de génome

Cvit La description

CVIT, court pour l'outil de visualisation du chromosome est conçu comme une application PERL pouvant être utilisée pour générer rapidement des images PNG indiquant des fonctionnalités sur une variété de cartes ou de séquences génomiques. Il est intentionnellement simple et non interactif, bien qu'il soit possible d'envelopper CVIT à l'intérieur, par exemple, des pages Web interactives. L'entrée consiste en un ou plusieurs fichiers de données au format GFF3. Les données doivent contenir des enregistrements décrivant un ou plusieurs "chromosomes" (pouvant représenter un groupe de liaison, PsueDomolecule, BAC, Contig, toute sorte de tronçon contiguelle d'ADN, voire une structure protéique). Ces "chromosomes" sont la colonne vertébrale que les caractéristiques sont placées. CVIT affichera tout système de coordonnées contiguës, y compris des paires de base, des cartes génétiques (cartes génétiques) et CentimcClintoks (cartes cytogénétiques). Les coordonnées peuvent être avancées (plus petites au plus grand) ou en arrière (les plus grandes aux petites). La sortie consiste en une image PNG du ou des chromosomes et des fonctions, une image de légende et une liste de coordonnées de fonctionnalités.

Cvit Logiciels associés