Converger Evolution convergente et parallèle au niveau de séquence d'acides aminés
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Converger Classement & Résumé

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séquence acide police acide Transaction acide Trouver l'acide aminé Finder d'acides aminés rechercher un acide aminé Analyseur d'acides aminés Séquence d'acides aminés acide aminé Traducteur d'acide aminé thème acide extraire l'acide aminé solution acide résidus d'acides aminés acide aminé optimal Séquence d'acide nucléique Analyser l'acide aminé acide nucléique analyser la paire d'acides aminés Analyse des paires d'acides aminés Analyse de séquence d'acides aminés Analyser la séquence d'acides aminés Classification des acides aminés Topologie d'acides aminés Évolution convergente Évolution parallèle Convergent Détecteur d'acides amino détecter l'acide amino-acide Évolution de la séquence Évolution de la séquence d'ADN Analyser la chaîne d'acides aminés Transactions acides pro acide acide pro 7

Converger La description

Cette application a été développée pour tester l'évolution convergente et parallèle au niveau de séquence d'acides aminés. Il calcule les probabilités que les substitutions observées convergentes et parallèles sont attribuables au hasard au hasard. Ce paquet contient un programme: Converg2.exe, qui est écrit en langage C. Pour utiliser le programme, vous avez besoin d'un fichier d'entrée contenant les séquences d'acides aminés et la topologie des arbres de ces séquences (voir Lysozyme.aa pour un exemple). Ce fichier commence par deux chiffres: le nombre de séquences et le nombre de sites d'acides aminés (longueur de séquence). La deuxième ligne sera le nom de la première séquence et la troisième ligne sera la première séquence, etc. Seul le code d'une lettre (capitalisé) pour les 20 acides aminés est autorisé dans les séquences. Les séquences doivent être alignées et des lacunes ou tout autre symbole déjà supprimé. La dernière ligne du fichier est la topologie des arbres des séquences. Le format de l'arbre est identique à celui utilisé dans le paquet PHYLIP (Felsenstein 1995). Notez que l'arborescence est introduite, la triification plutôt que la négociation est requise pour le nud de ramification le plus profond.

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