MalImps est une petite application basée sur la commande de commande conçue pour vous offrir des procédures d'alignement multiples qui sont des parallèles proches de ceux utilisés pour rechercher des cladogrammes de longueur minimum. Les topologies d'alignement sont construites via différentes séquences et améliorées par l'échange de branches. Chaque topologie d'alignement donne un alignement multiple et des cladogrammes sont construits à partir de cet alignement. Le coût du cladogramme le plus parsimonieux est ensuite attribué comme coût d'alignement multiple.
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