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Associationviewer La description

AssociationViewer est un programme basé sur Java conçu pour être utilisé dans l'analyse du génome entier pour afficher les SNP dans un contexte génomique. Les données supplémentaires sont téléchargées à partir de diverses sources de données publiques à la volée et enregistrées localement dans une cache et des données personnalisées peuvent être ajoutées en tant que pistes supplémentaires. Caractéristiques principales: affiche les SNP et leurs valeurs de P dans un contexte génétique, similaire aux navigateurs de génome habituel Télécharger automatiquement des informations supplémentaires à partir de Ensembl / Biomart Afficher les parcelles HAPMAP LD Imprimez et exportez l'affichage sur divers formats de données importer un fichier de données externe tel que lit ou wiggle en tant que pistes supplémentaires n'a pas besoin d'avoir une copie locale d'une source de données ou de données de données, à l'exception du fichier principal des SNP et de leurs valeurs P respectives Les utilisateurs peuvent faire défiler et parcourir leurs données en temps réel de petite taille (AssociationViewer elle-même est inférieure à 800 Ko, moins de 5 Mo avec les bibliothèques requises) Les données téléchargées sont conservées dans une cache localement pour un accès plus rapide En raison du cache, la mémoire est raisonnable

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