Qtl Reaper QTL Reaper est un logiciel permettant de numériser rapidement des données d'expression de micropuce pour QTLS.
Télécharger maintenant

Qtl Reaper Classement & Résumé

Qtl Reaper Mots clés

bio-informatique Microréseau Calculatrice QTL Scanner de puce Application bioinformatique QTL

Qtl Reaper La description

QTL Reaper est un logiciel permettant de numériser rapidement des données d'expression de micropuce pour QTLS. QTL Reaper est un logiciel, écrit en C et compilé sous forme de module Python, pour numériser rapidement les données d'expression de micropuissage pour QTLS. C'est essentiellement la version de WebQTL orientée par lots. Comme entrée, des données d'expression des membres d'un ensemble de lignes intégrées recombinantes et d'informations génotypes pour les mêmes lignes. Il cherche une association entre chaque trait d'expression et tous les génotypes et évalue cette association par un test de permutation. Pour le test de permutation, il effectue uniquement autant de permutations que nécessaire pour définir la valeur p empirique à une précision raisonnable. Il effectue également un rééchantillonnage de bootstrap pour estimer la région de confiance pour l'emplacement d'une QTL putative. Conditions requises: · Python · Bibliothèque BLAS · Lapack LibraryInstallation: Première Gunzip et Domaine du fichier de paquet. Entrez le répertoire Qtlreacto compiler qtlreact module, exécuter: python setup.py Catégorie Vous pouvez également modifier le script Setup.py si votre système ne dispose pas de la bibliothèque BLAS etPack installé et que vous souhaitez utiliser celles incluses dans ce package. Pour installer qtlreager Module, Exécuter: Python Setup.py Installez les nouvelles dans cette version: · Augmentez le locus maximum dans un seul chromosome de 200 à 500 · Nouveau code pour calculer les marqueurs manquants

Qtl Reaper Logiciels associés