ilap Une application qui combine le développement de protocoles expérimentaux avec une analyse de données liée à la micro-biologie dans un seul système intégré intégré
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ilap Classement & Résumé

ilap Mots clés

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ilap La description

La biologie moderne confronte des scientifiques avec le défi décourageant de stocker des données hétérogènes de manière structurée et organisée. Parmi les solutions de gestion des données disponibles, il n'existe aucun système intuitivement utilisable qui couvre le flux de travail complet d'expériences de microscopie. ILAP (gestion des données de laboratoire, analyse et développement de protocoles) est un logiciel créé pour fournir une solution qui combine le développement de protocoles expérimentaux, l'acquisition de données basée sur une assistant et l'analyse de données à haut débit en un seul système intégré. Une caractéristique unique de l'ILAP est qu'elle prend en charge la phase de conception expérimentale. Les protocoles de travail que les scientifiques développent pour des expériences de laboratoire humide peuvent être stockés et modifiés dans l'ILAP. Finalement, ces protocoles conduisent à l'acquisition de données d'image. ILAP fournit ensuite un magicien d'acquisition de données pour aider le scientifique à associer les données d'image acquises avec des étapes du protocole. Les initiatives de normalisation, telles que les erreurs de normalisation pour l'hybridation in situ de fluorescence de l'ADN, peuvent être soutenues en appliquant l'entrée des paramètres requis lors de cette acquisition de données. La transformation et l'analyse supplémentaires des données d'image brute peuvent être effectuées avec des modules d'analyse développés spécifiquement au sein de l'ILAP ou avec des programmes de tiers externes. Les observations visuelles intéressantes peuvent être documentées comme des notes à tout endroit. ILAP est un projet open source qui est librement disponible pour la communauté de la microscopie. Il a été essentiellement testé dans notre installation de microscopie interne et la rétroaction continue des utilisateurs a entraîné des améliorations de la fonctionnalité, de la convivialité et de la réactivité. Une vertu distincte d'ILAP est qu'elle conduit intrinsèquement à l'enregistrement structuré d'expériences, à la conservation du contexte expérimental complet des enregistrements de données tout au long de l'historique du projet de recherche.

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