comptes Extraire des informations codées à partir de rapports de pathologie chirurgicale de texte libre
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caTIES ou cancer Text System Information Extraction est un projet axé sur deux défis importants de problèmes bioinformatics.The qui veulent être overcomed sont liés à l'extraction de l'information de texte libre et l'accès aux tissus. Plus précisément, caTIES a trois objectifs principaux: · Des informations codées Extrait du texte libre Surgical Rapports (pathologie SPR), en utilisant des terminologies contrôlées pour remplir les structures de données conformes caBIG. · Fournir aux chercheurs la possibilité d'interroger, naviguer et créer des commandes pour les données de tissus annoté et matériel physique à travers un réseau de sources fédérées. Avec le caTIES SPR agit comme un localisateur de ressources de tissus. · La recherche Pioneer pour l'extraction de l'information de texte distribué dans le cadre de caBIG. Caractéristiques principales: Caractéristiques de codage: codes sémantiquement texte avec les concepts du NCI Metathesaurus. Classifie concepts codés que le type de diagnostic, de procédure ou d'organes. utilise un moteur intégré dans la négation d'identifier la négation explicite dans le texte. Rechercher Caractéristiques: concept supports à base des recherches. En plus de retourner des résultats contenant les termes de recherche, le concept des recherches basées retour également des résultats qui contiennent des synonymes des termes de recherche. soutient la recherche des concepts niée. Pour exemple vous pouvez rechercher des « adénocarcinomes Négation », qui renverrait les résultats qui avaient une négation explicite pour adénocarcinomes. à savoir des déclarations telles que « aucune preuve de adénocarcinomes » ou « adénocarcinomes introuvable » doit être présent dans le rapport. Prise en charge des requêtes temporelles. Pour exemple vous pouvez interroger pour les patients qui ne présentaient aucun signe de thyréotrope adénome moins de 3 ans avant d'être un diagnostic avec Brain hémangiome Est-ce un outil de modélisation graphique unique requête pour formuler facilement des requêtes complexes. Utilise l'ontologie des informations pour améliorer les résultats de recherche. Pour. par exemple. la recherche de « vascularite » renverra des rapports avec tous les sous types de vascularite, même si le mot « vascularite » ne figure pas dans le rapport. limiter les recherches à l'intérieur de certaines sections du rapport. Prise en charge le marquage des rapports, puis la recherche de rapports avec des balises spécifiques. Autres caractéristiques: caTIES Screenshot caTIES Screenshot (cliquez pour agrandir l'image ouvrir) caTIES est open source. peut importer des données à partir de fichiers HL7. texte Deidentifies de se conformer à la réglementation HIPAA en utilisant des programmes tiers de-identifier. Il a un client riche et épais qui est accessible en ligne via Java Webstart. Il utilise des protocoles de cryptage sécurisés pour protéger toutes les communications. Possibilité d'utiliser des mots de passe et connectez-vous toutes les activités de recherche à des fins de vérification. Prise en charge des opérations de tissus bancaires et honnête courtier. Prend en charge plusieurs nuds caTIES dans toutes les organisations. support entièrement intégré pour

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