Triplec Un programme pour construire des arbres consensus à partir de triples enracinés
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Triplec Classement & Résumé

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Triplec La description

TripLec a été développé pour être un programme visant à construire des arbres consensus à partir de triples enracinés. usage java -jar triplec.jar noreps infilace.newick Ici Noreps est le nombre de triples reconstructions à utiliser pour le consensus. Ceci est nécessaire car la reconstruction est un algorithme randomisé. Pour les petits arbres d'environ 20 taxa, 1000 réplicats suffit. Mais des nombres plus importants doivent être utilisés pour des ensembles de données plus gros. Infile.Newick est un fichier texte avec un arbre neufick par ligne. Les arbres sont considérés comme enracinés et chaque arbre ne doit contenir que les étiquettes de taxa du premier arbre. C'est des arbres après la première ne pas contenir de nouveaux taxons. Bien que ce ne soit pas une erreur d'avoir des arbres moins taxa que le premier arbre dans le cadre du consensus, cette méthode n'est pas une méthode Super-Tree. La performance dans ces conditions n'a pas été testée et nous prévoyons que cela fonctionnerait mal.

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