Tesd simule le nombre de copies génomiques de TE dans différentes populations entre générations
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Tesd Classement & Résumé

Tesd Mots clés

simuler simulateur Région génomique Méthylation méthylation génomique Voir les informations génomiques Analyser les informations génomiques Visionneuse de l'information génomique Voir les données génomiques Visionneuse de données génomiques Explorez les données génomiques séquence génomique de mammifère Simulateur génomique simulation génomique Simulateur d'élément génomique Générations Wright-Fisher Accéder à la diversité génomique Simulation de données génomiques analyser des données génomiques Variation structurelle génomique Loci génomique Annoteur génomique

Tesd La description

Le nom TESD représente une dynamique de simulateur de simulateur transposable. TESD a été développé pour être une application scientifique. TESD simule le nombre de copies génomiques de TE dans différentes populations entre générations (selon le modèle îlot), en utilisant des modèles classiques de Te Dynamics. Les paramètres des modèles (taux de transposition et d'excision, d'intensité de sélection, de taux de recombinaison, de taux de migration, de tailles de population et de nombre de populations) sont définis par les utilisateurs. Pour le rendre plus convivial, TESD a une interface graphique. Les utilisateurs peuvent définir les différentes valeurs de paramètres à l'aide de formulaires qui posent des questions. Les résultats des simulations sont visualisés grâce aux outils graphiques intégrés, à l'aide de la bibliothèque Jfreechart. TESD fournit une application complète qui permet aux modélisateurs de mettre en uvre d'autres modèles de Te Dynamics. TESD est implémenté dans Java, une langue orientée objet qui peut être étendue facilement, ce qui signifie que TESD peut être exécuté sur tous les systèmes d'exploitation (Linux, Mac, Windows, Solaris, etc.).

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