RECCO est un outil à base de Java pratique, facile à utiliser, spécialement conçu pour vous aider à analyser des alignements de séquences évoluées sous réserve de recombinaison et de mutation. L'analyse fournit des éléments de preuve sur le point de savoir si une carte de données contient une recombinaison, laquelle séquence est un recombinant et où les points d'arrêt de recombinaison sont. L'analyse est également basée sur l'explication d'une séquence avec toutes les autres séquences de l'alignement à l'aide de la mutation et de la recombinaison. Une analyse paramétrique du paramètre alpha, qui pondère les coûts de recombinaison contre les coûts de mutation, donne des informations supplémentaires sur lesquelles la séquence pourrait être recombinante.
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