Vue sur la mer

Cette application est capable de lire et d'écrire divers formats d'alignement.
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Vue sur la mer Classement & Résumé

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  • Rating:
  • Licence:
  • GPL
  • Nom de l'éditeur:
  • Manolo Gouy
  • Systèmes d'exploitation:
  • Windows All
  • Taille du fichier:
  • 1.1 MB

Vue sur la mer Mots clés


Vue sur la mer La description

SeaView est une application logicielle conçue spécifiquement pour vous aider à étudier et à analyser des alignements de séquence ainsi que de la phylogénie moléculaire. Il intègre des capacités de lecture et d'écriture de divers formats de fichiers, tels que Nexus, MSF, Clustal, FASTA, PHYLIP, MASE et NEWICK Files. Portable PackageThis est un programme autonome qui peut être exécuté directement sur votre ordinateur sans être installé d'une manière qui modifie vos informations de configuration de registre Windows. Vous pouvez stocker l'utilitaire sur tous les périphériques de stockage tels que des disques flash USB. La meilleure partie lorsque vous utilisez des outils portables est que vous n'avez pas besoin de privilèges d'administrateur pour exécuter les programmes car ils ne laissent pas de fichiers ni de paramètres sur l'ordinateur hôte. L'interface utilisateur de l'utilisateur L'interface graphique n'impressionne pas beaucoup dans le service visuel, elle est réellement pratique et facile à travailler. La prise en charge du glisser-déposer est également sur la liste des fonctionnalités afin que vous puissiez rapidement importer des données à partir d'un fichier externe. Vous pouvez utiliser des raccourcis clavier pour explorer des données ou appuyer sur les clics de souris pour sélectionner les éléments et déplacer des séquences sélectionnées sur un autre endroit dans un alignement. L'outil peut également être exécuté à l'aide de la ligne de commande. Importation / exportation d'optionsAide à partir des formats de fichiers pris en charge énumérés dans l'introduction, vous pouvez ajouter des informations à partir de diverses bases de données, telles que EMBL, GENBANK et SWISSPROT / UNIPROT. De plus, vous pouvez enregistrer l'alignement dans le fichier actuel ou exporter des données dans un fichier, enregistrer l'alignement sur le format de fichier PDF (vous recevez la liberté de modifier la police, le bloc et la taille du papier, de modifier la couleur et de la sortie uniquement des sites variables. de l'alignement et de leurs positions). Vous êtes autorisé à ajouter un alignement à la fin d'une autre par nom ou par rang. Caractéristiques de montage et alignement OptionsSeVieweView vous permet de copier les séquences sélectionnées dans le Presse-papiers, de coller des données d'alignement dans le presse-papiers, sélectionnez toutes les séquences de l'alignement, renommez la séquence actuellement sélectionnée, modifier des commentaires, ainsi que modifier une séquence en collant externe données ou ouvrir deux panneaux de séquence d'édition et transférer des informations entre eux. D'autres tâches pratiques pouvant être appliquées aux séquences font référence à la suppression, à la création et à la chargement. De plus, vous pouvez les dupliquer et les inverser, effectuer une analyse de la parcelle de points, supprimez tous les sites Gap de l'alignement et définissez le code génétique pour traduire en protéines la ou les séquences sélectionnées. En ce qui concerne les actions qui vous aident à gérer des alignements, vous pouvez exécuter l'alignement de la cible sur toutes les séquences ou sélectionnées, des sites sélectionnés ou un profil (plus spécifiquement un groupe de séquences préalignées). Les paramètres de configuration et les autres outils puissantsIaView vous permettent de définir la taille de la police utilisée pour afficher les séquences d'affichage, affichez des séquences d'ADN en tant que protéines, utilisez des règles de couleur pour définir les séquences protéiques, générer des statistiques sur les compositions de séquence de base ou d'acides aminés, les comptes de transition et de transversion, spécifiez le Parties d'un alignement multiple à stocker pour une analyse plus approfondie, créez et stockez des ensembles d'espèces si le format MASE ou NEXUS est utilisé, insérez des lignes de commentaire en bas de l'écran et effectuez des recherches. En outre, vous pouvez calculer, dessiner, importer et sauvegarder des arbres phylogénétiques de l'ADN ou des protéines, de l'intrigue, de l'impression d'impression et de copier des arbres phylogénétiques et effectuez une analyse «parcelle de points» de deux séquences. Ligne de fond Dans l'ensemble, Seaview s'avère être un programme avancé pour l'alignement de plusieurs séquences et la phylogénie moléculaire, et convient particulièrement aux utilisateurs de puissance. Avis écrit par Ana Marculescu, dernière mise à jour le 26 septembre 2014


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