Décgpu

Algorithme de correction pour votre GPU
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Décgpu Classement & Résumé

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  • Rating:
  • Licence:
  • GPL
  • Nom de l'éditeur:
  • Yongchao Liu
  • Systèmes d'exploitation:
  • Windows All
  • Taille du fichier:
  • 132 KB

Décgpu Mots clés


Décgpu La description

DecGPU, également appelée correction d'erreur distribuée sur GPU est un algorithme de correction d'erreur parallèle et distribué pour des lectures courtes produites par la technologie de séquençage de nouvelle génération. L'algorithme est mis en uvre à l'aide de Cuda C ++ et de MPI et peut fonctionner sur un groupe GPU ou CPU. La caractéristique parallèle et distribuée de cet algorithme le rend réalisable et flexible pour surmonter les défis de la surcharge de calcul et de la contrainte de mémoire à grande échelle Datasets de lecture courts à haut débit. Cet algorithme a été testé sur un cluster Telsa S1070 avec des bibliothèques OpenMPI et MVAPICH2.


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