jmodelest Modèle phylogénétique Moyenne
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jmodelest Classement & Résumé

jmodelest Mots clés

phylogénétiques systématique substitution nucléotide Analyse phylogénétique analyseur phylogénétique empreinte phylogénétique contexte phylogénétique phylogénétique Vérifiez la sonde phylogénétique vérificateur de sonde phylogénétique Testez la sonde phylogénétique calculer le réseau phylogénétique Substitution de nucléotide Modèle phylogénétique en moyenne Modèle phylogénétique Stocker le réseau phylogénétique Analyser les données phylogénétiques Données phylogénétiques parcimonie des tâches phylogénétiques Analyses phylogénétiques construire des supertrees phylogénétiques créer des supertrees phylogénétiques Test de l'indépendance phylogénétique Analyse phylogénétique typique hypothèse phylogénétique Relation phylogénétique reconstruction phylogénétique Topologie phylogénétique Générateur phylogénétique Pic en moyenne

jmodelest La description

JMODELTEST est une application scientifique pouvant effectuer une sélection de substitutions de nucléotides, utiles dans l'analyse de l'ADN, avec la prise en charge des grands paquets de données. Il s'agit d'un projet à la plate-forme open-plate-forme qui cible les étudiants, les enseignants, ainsi que les chercheurs dans le domaine de l'ADN. La majeure partie de l'analyse est effectuée automatiquement, cependant, des connaissances avancées de nucléotides sont attendues de l'utilisateur, principalement pour l'interprétation des résultats. JModelTest s'appuie sur l'environnement Java Runtime pour fonctionner avec succès, mais c'est la seule dépendance dont vous avez besoin. Il est entré dans un emballage portable, l'installation n'est donc pas nécessaire. L'interface de Jmodelest est assez simple, mais les fonctions intégrées à l'intérieur sont de nature plus complexe. La majeure partie de l'interface graphique est dédiée à l'analyse des données et aux rapports résultant de ce processus, qui, selon les informations contenues dans le fichier source, peuvent être assez longs. Il existe cinq stratégies de sélection différentes et sont incorporées dans le menu d'analyse, comme suit: AIC (critère d'informations AKAIKE), BIC (critère d'information bayésien), DT (Théorie de la décision), HLRT (tests de vraisemblance hiérarchique) et la moyenne phylogénique. Tous ces éléments peuvent être configurés avant le processus d'analyse réel; Par exemple, vous pouvez ajuster l'intervalle de confiance ou définir l'application pour effectuer une moyenne de la moyenne. Pour terminer la fin, vous pouvez également instruire le programme de calculer un calcul de vraisemblance qui dépend d'une variation de taux personnalisable et d'un modèle d'arborescence de base présélectionnée. En conclusion, JMODELTEST peut enregistrer le temps et les efforts que les scientifiques investiraient dans la réalisation des opérations d'analyse de l'ADN par des moyens traditionnels. Cependant, il est recommandé que les résultats soient parfaitement vérifiés, au cas où. Commenté par Andreea Matei, dernière mise à jour le 17 août 2014

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