Satlotyper Inférence aux haplotypes des données SNP non imphéra dans des polyploïdes hétérozygotes à base de SAT
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Satlotyper Classement & Résumé

Satlotyper Mots clés

moteur d'inférence Système d'inférence fuzzy Site du mien SNP Analyser le site SNP Estimation des haplotypes estimer l'haplotype haplotype commun dessiner haplotype haplotype de peinture haplotype Marqueurs SNP SNP tag génotype SNP inférence variationnelle inférence arbre haplotype inférence d'haplotype Opérateur booléen polyploïde hétérozygote hétérozygote Inference outil Recherche SNP Télécharger SNP filtre SNP Analyser les microréseries SNP inférence de phylogénie Décrire l'haplotype séquence à haplotype Analyse de haplotype Analyse de blocs haplotype Test d'association haplotype Grande inférence de phylogénie Identification du SNP association d'haplotypes Données de haplotype Haplotype Y-chromosomal Affymetrix SNP Tableaux

Satlotyper La description

SatLotyper est un outil logiciel conçu pour inférer les haplotypes à partir de données SNP non imphisées polyploïdes et polyléliques. SatLotyper utilise des opérateurs et des variables booléens pour formuler l'inférence sur les haplotypes par pure parcimonie (HIPP) pour le problème de satisfaction booléen (SAT). Pour trouver l'ensemble le plus parcimonieux d'expliquer des haplotypes, SatLotyper commence par supposer un haplotype expliquant et augmente le nombre de haplotypes jusqu'à ce qu'un ensemble satisfaisant soit trouvé. Étant donné que SAT est rempli de NP, il ne peut pas être garanti qu'une solution est trouvée dans un délai raisonnable pour une donnée donnée. Cependant, les tests empiriques ont montré qu'il est possible de calculer les inférences pour les données du monde réel. En outre, Satlotyper donne des contraintes pour des solutions d'explication alternatives et est capable d'optimiser la probabilité du résultat au moyen d'une procédure de bootstressage. Donnez à Satlotyper un essai de voir à quel point il peut être utile pour vous!

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