Rococo

Reconstruction de régions contiguës conservées
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Rococo Classement & Résumé

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  • Rating:
  • Licence:
  • Freeware
  • Nom de l'éditeur:
  • Roland Wittler
  • Systèmes d'exploitation:
  • Windows All
  • Taille du fichier:
  • 447 KB

Rococo Mots clés


Rococo La description

Rococo est un petit utilitaire conçu pour reconstruire les grappes de gènes ancestraux. Compte tenu de la topologie d'un arbre phylogénétique et des commandes de gènes des nuds de feuilles, elle calcule des ensembles optimaux de grappes de gènes pour les nuds internes. Le critère d'optimisation combine deux propriétés: le parcimonie, c'est-à-dire que le nombre de gains et pertes de grappes de gènes doit être minime et consistance, c'est-à-dire à chaque nud ancestral, il doit exister au moins un ordre de gène potentiel contenant toutes les grappes reconstruites.


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