Haplowser

Parcourir les haplotypes et leurs annotations dans des génomes entiers
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Haplowser Classement & Résumé

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  • Rating:
  • Licence:
  • GPL
  • Nom de l'éditeur:
  • Sanghyun Park
  • Systèmes d'exploitation:
  • Windows All
  • Taille du fichier:
  • 2 KB

Haplowser Mots clés


Haplowser La description

HAPLOWSER est une petite application qui vous permet d'afficher et d'analyser des séquences d'ADN. Un utilisateur peut créer ou ouvrir des fichiers de projet (* .prj Files), chacun d'entre eux consiste en une séquence de génome de référence et des séquences de génome alignées sur la séquence de génome de référence. La fenêtre principale est divisée en 5 plus petites fenêtres: fenêtre d'alignement multiple, fenêtre de tracé d'alignement, fenêtre d'annotation verticale (pour une séquence de référence) et fenêtre d'annotation horizontale (pour séquences alignées), fenêtre de la propriété Caractéristiques principales: au lieu de séquences haploïdes, naviguez sur des haplotypes avec des annotations de gènes et des pistes personnalisées. Plusieurs alignements des haplotypes sont affichés au niveau de la base. Après que les séquences de gènes haploïdes soient mappées sur des haplotypes, des séquences gènes diploïdes peuvent être enregistrées en utilisant une opération de souris. hétérozygosité existant à des haplotypes est résumée et facilement navigue par un utilisateur. Toutes les fonctions sont fournies mais une interface utilisateur intuitive.


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