Collagène Rechercher des séquences CLP dans les nucléotides
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CF, qui est en fait court pour Collagenfinder, a été développé comme une pièce de logiciels Perl facile à utiliser permettant à ses utilisateurs de trouver des séquences CLP dans une séquence nucléotidique donnée. Collagenfinder est un outil capable de numériser la séquence nucléotidique dans les six cadres de lecture possibles. Les procédures de filtrage supplémentaires fournissent une prédiction de CLP plus précise: · Détectionner pour un résidu de tryptophane et des codons d'arrêt et enlever les CLP correspondants, · Valeur de coupure par numéro de répétition GXY. Si nous avons besoin de CLP avec la longueur 36 et plus, nous devrions utiliser une valeur de coupure égale à 4.

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