Analyse et visualisation SAVI Signalisation

Analysez et visualisez des signaux cellulaires et des réseaux en composants cellulaires.
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Analyse et visualisation SAVI Signalisation Classement & Résumé

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  • Rating:
  • Licence:
  • Free
  • Nom de l'éditeur:
  • Mount Sinai School of Medicine Ma'ayan
  • Site Internet de l'éditeur:
  • http://www.mssm.edu/labs/maayan
  • Systèmes d'exploitation:
  • Windows Me, Windows 98, Windows 95, Windows 2000, Windows NT, Windows XP
  • Taille du fichier:
  • 20.35MB

Analyse et visualisation SAVI Signalisation Mots clés


Analyse et visualisation SAVI Signalisation La description

Visualisation des interactions protéine-protéine et de protéines de la protéine sous forme de graphiques (réseaux), où les biomolécules sont représentées sous forme de nuds et leurs interactions sont représentées comme des liens, constitue une approche prometteuse pour intégrer les résultats expérimentaux de différentes sources pour la compréhension systématique des mécanismes moléculaires du phénotype des cellules moléculaires. . L'émergence de réseaux de signalisation à grande échelle offre une occasion d'une analyse statistique topologique, tandis que la visualisation de ces réseaux représente un défi. SADI implémente des méthodes standard pour calculer la clustering, la distribution de connectivité et la détection, ainsi que la visualisation, des motifs de réseau. De plus, SAVI génère un site Web complet à partir de jeux de données réseau en format texte. Savi contient un outil appelé PathwayGenerator. Cet outil crée des cartes de connexion en tant que pages Web à partir de grandes tables décrivant les interactions de signalisation cellulaire. SAVI peut également créer des réseaux à partir de listes de noms de gènes / protéines. La version 2.5 peut inclure des mises à jour, des améliorations ou des corrections de bugs non spécifiées.


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