qpure outil pour évaluer la cellularité de l'échantillon de tumeurs des tableaux SNP
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qpure Classement & Résumé

qpure Mots clés

SNP

qpure La description

QPure est développé comme un emballage R accessible et pratique qui vous permet d'estimer la pureté de la tumeur ou la cellularité à l'aide de données de polymorphisme mono-nucléotidique (SNP) à partir d'échantillons de tumeurs / couplus normaux. Les avantages de l'utilisation de la méthode QPure pour l'estimation de la cellularité de la tumeur sont qu'il s'agit d'une approche statistique impartiale qui mesure directement le contenu de la tumeur de l'échantillon que l'ADN a été extrait. Notre étude récente (manuscrit en préparation) suggère que la méthode QPure est un outil essentiel pour estimer la cellularité tumorale avant d'effectuer un séquençage à haut débit sur des échantillons de cancer. Cette vignette donne une introduction de style tutoriel à la fonction du package QPure. Les fonctions fournissent le score QPure pour chaque échantillon étant donné leur SNP Pro EL GENOMABLE généré à partir d'illumina SNP Chips.

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