métaprot

Pipeline pour analyser les régions de codage dans des projets métagénomiques
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métaprot Classement & Résumé

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  • Rating:
  • Licence:
  • GPL
  • Nom de l'éditeur:
  • MR Orejuela
  • Systèmes d'exploitation:
  • Windows All
  • Taille du fichier:
  • 37 KB

métaprot Mots clés


métaprot La description

METAPROT a été développé en tant que pipeline Python open source qui vous donne la possibilité d'analyser les données de protéines à partir de projets métagénomiques afin de décrire l'échantillon avec la quantité maximale de données disponibles. De nos jours, il existe une énorme quantité d'outils vraiment informatifs pour caractériser les données de séquençage, mais parfois on ne suffit pas et à la fin, beaucoup d'entre eux sont utilisés de manière intégrative. Pour simplifier et automatiser le processus, nous pouvons utiliser des scripts / programmes de pipeline, comme MetaProt. Le pipeline par défaut a été implémenté dans des protéines d'esprit, mais si vous souhaitez utiliser des séquences de nucléotides, n'hésitez pas à télécharger les bases de données que vous souhaitez utiliser.


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