carnac

Prédire la structure secondaire pour un ensemble de séquences d'ARN homologues
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carnac Classement & Résumé

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  • Rating:
  • Licence:
  • Freeware
  • Nom de l'éditeur:
  • Bonsai Bioinformatics group
  • Systèmes d'exploitation:
  • Windows All
  • Taille du fichier:
  • 309 KB

carnac Mots clés


carnac La description

Carnac est un outil logiciel permettant d'analyser la structure secondaire hypothétique d'une famille d'ARN homologue. Il vise à prédire si les séquences partagent réellement une structure secondaire commune. Lorsque cette structure existe, Carnac est ensuite capable de récupérer correctement une grande quantité de tiges pliées. L'entrée est un ensemble de séquences d'ARN à une échelle qui ne doivent pas être alignées. La stratégie de pliage s'appuie sur un modèle thermodynamique avec une minimisation d'énergie. Il combine des informations provenant des éléments conservés localement de la structure principale et des informations mutuelles entre séquences avec des covariations. Obtenez Carnac et essayez-le pour vous de voir à quel point cela peut être utile pour vous!


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