Vmd moléculaire VMD est un programme de visualisation moléculaire d'affichage, d'animation, et plus encore.
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Vmd moléculaire Classement & Résumé

Vmd moléculaire Mots clés

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Vmd moléculaire La description

VMD est conçu pour la visualisation et l'analyse de systèmes biologiques tels que des protéines, des acides nucléiques, des assemblages de bicouches lipidiques, etc. Il peut être utilisé pour voir plus de molécules générales, comme VMD peut lire Fichiers de banque de données de protéines standard (PDB) et affiche la structure contenue. VMD fournit une grande variété de méthodes de rendu et de molécule de coloration. VMD peut être utilisé pour animer et analyser la trajectoire des simulations de dynamique moléculaire (MD) et peut manipuler de manière interactive des molécules simulées sur des ordinateurs distants (MD interactifs). Les principales fonctionnalités de la VMD incluent: Prise en charge de toutes les principales plates-formes informatiques Soutien aux processeurs multicurs Prise en charge du calcul accéléré du GPU De nombreux excellents tutoriels VMD développés localement et par la communauté de recherche en général Aucune limite sur le nombre de molécules, atomes, résidus ou nombre de cadres de trajectoire, à l'exception de la mémoire disponible Beaucoup de méthodes de rendu moléculaire et de coloration Capacité d'affichage stéréo Syntaxe de sélection d'atomes étendue pour choisir des sous-ensembles d'atomes d'affichage (comprend des opérateurs booléens, des expressions régulières, etc.) Prise en charge de plus de 60 formats de fichiers moléculaires et de types de données via une vaste bibliothèque de plugins de lecteur / écrivain intégré et de traducteurs VMD comprend un plugin d'alignement de séquences multiples, un environnement d'analyse bioinformatique unifié qui permet d'organiser, d'afficher et d'analyser les données de séquence et de structure pour les protéines et les acides nucléiques. Possibilité d'exporter des graphiques affichés vers des fichiers pouvant être traités par un certain nombre de packages de traçage et de rendu d'image populaires, y compris POV-Ray, Rayshade, Raster3D et Tachyon. Interfaces utilisateur graphiques et textuelles extensibles par l'utilisateur, les langages de script TCl / TK et Python intégrés Extensions dans la langue TCL qui permettent aux chercheurs d'écrire leurs propres routines d'analyse moléculaire

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