Transposonpsi Un outil d'analyse permettant d'identifier l'homologie de séquence d'acide protéine ou nucléique
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Transposonpsi Classement & Résumé

Transposonpsi Mots clés

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Transposonpsi La description

Modifier par Transposonpsi est un outil d'analyse permettant d'identifier une séquence d'acide protéine ou de la séquence d'acide nucléique aux protéines codées par diverses familles d'éléments transposables. PSI-Blast est utilisé avec une collection de profils d'homologie (rétro-) Transposon d'orf pour identifier des alignements statistiquement significatifs. Cette méthode peut être utilisée pour identifier les ORF de transposon potentiels dans un ensemble de protéines ou pour identifier les régions d'homologie de transposon dans une séquence de génome plus importante. Ceci est particulièrement utile pour identifier des homologies de transposon dégénéré dans les séquences de génome qui échappent à l'identification et à la masquage à l'aide de Repeatmasker et d'une bibliothèque de nucléotides associée d'éléments répétitifs. Transposonpsi a été régulièrement utilisé à l'Institut de recherche génomique pour aider à la découverte d'éléments mobiles à travers les eucaryotes, y compris les protozoaires, les plantes, les champignons et les animaux.

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