Spindel Workbench Acquérir une méthode d'identification des espèces dans tous les domaines de la vie à l'aide d'une analyse multiplex.
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Spindel Workbench Classement & Résumé

Spindel Workbench Mots clés

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Spindel Workbench La description

Le Spindel est une approche alternative pour l'identification biologique basée sur la longueur des régions de gènes ribosomales d'ARN (ARRN). En général, les alignements des séquences de gènes d'ARN principaux provenant de différentes espèces montrent des régions alternées de conservation et de variation de nucléotides, à la fois en termes de substitution de nucléotides (communément appelées "SNPS") et d'insertion / délétion (Indel). La présence d'indemnes entraîne des séquences de différentes longueurs et introduit des lacunes dans l'alignement, notamment désignées par un tableau de bord "-". Notre concept d'identification biologique utilise des séquences de gènes d'ARRN comme suit: Les régions conservées sont utilisées pour définir des segments variables ("régions hypervariables de spindel") dans lesquelles une combinaison de longueurs de séquence est caractéristique de chaque espèce (un "profil de spindel"). Ainsi, chaque espèce peut être définie par un profil numérique unique. En théorie, une enquête de seulement 6 régions hypervaritaires avec 20 allèles chacune (ou 11 régions avec 5 allèles chacune) est suffisante pour discriminer toutes les espèces eucaryotes sur Terre, estimées entre 5 et 15 millions de dollars. Dans la pratique, Spindel est capable de discriminer 93,3% des espèces eucaryotes à faible variation intraspécifique et résolution phylogénétique élevée.

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