Seq moine

SEQMONK est un programme permettant de permettre la visualisation et l'analyse des données de séquence mappées. Il a été écrit pour une utilisation avec des données de séquence de génération de nouvelle génération mappées, mais peut être utilisée en théorie pour tout ensemble de données qui
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Seq moine Classement & Résumé

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  • Rating:
  • Licence:
  • GPL
  • Nom de l'éditeur:
  • Babraham Bioinformatics
  • Site Internet de l'éditeur:
  • http://www.bioinformatics.bbsrc.ac.uk
  • Systèmes d'exploitation:
  • Windows All
  • Taille du fichier:
  • 2.1 MB

Seq moine Mots clés


Seq moine La description

Un outil visant à visualiser et à analyser les données de séquence mappées à haut débit SEQMONK est un programme permettant de permettre la visualisation et l'analyse des données de séquence mappées. Il a été écrit pour être utilisé avec des données de séquence mappées de prochaine génération, mais peut être utilisée en théorie pour tout ensemble de données pouvant être exprimée en tant que série de positions génomiques. Ses principales caractéristiques sont: * Importation de données mappées de données mappées (BAM / SAM / BOWTIE / MAQ, etc.) * Création de groupes de données pour la visualisation et l'analyse * Visualisation des régions mappées contre un génome annoté. * Quantitation flexible des données mappées pour permettre des comparaisons entre les ensembles de données * Analyse statistique des données pour trouver des régions d'intérêt * Création de rapports contenant des données et une annotation de génome


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