Scanner d'Arabidopsis Motif DÉLAVEZ LES RELATIONS ET LES FONCTIONS GENEES.
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Arabidopsis Motif Scanner (AMS) est une application Windows qui fonctionne sur des ordinateurs locaux. Il a été développé pour construire des réseaux de gènes en identifiant les positions des éléments de régulation de la CIS dans la plante modèle Arabidopsis Thaliana et en fournissant une interface facile à évaluer et à évaluer les relations de gènes. Sa caractéristique innovante majeure consiste à combiner les positions de l'élément de régulation de la CIS-réglementation, les NGS et les tableaux d'expression de la puce d'ADN, les annotations d'Arabidopsis et les interactions gènes pour l'identification des réseaux de gènes régis par des facteurs de transcription. Dans les études axées sur les facteurs de transcription fonctionne, le logiciel utilise les données d'expression et les motifs de site de liaison dans les régions de gènes de régulation afin de prédire les gènes cibles directs. De plus, AMS utilise des données d'interaction de protéines ADN et de protéine-protéines pour faciliter l'identification des voies métaboliques réglementées par le facteur de transcription d'intérêt.

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