SW Une bibliothèque simple pour l'alignement de séquence pouvant être utilisé avec plusieurs GPU
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SW Classement & Résumé

SW Mots clés

Aligner séquence aLIGN séquence alignement L'alignement des séquences

SW La description

Alignement de la séquence basé sur GPU activé par CUDA SW # (SWSHARP) est une bibliothèque d'alignement de la séquence basée sur les GPU activés par CUDA. Il utilise l'algorithme Hirschbergs et Ukkonens pour une efficacité de la mémoire et une vitesse supplémentaire. La bibliothèque est évolutive pour une utilisation avec plusieurs GPU. Certaines parties de la bibliothèque utilisent MPI pour les clusters compatibles Cuda.

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