SSA Un programme permettant de déduire des phylogénies maximales de vraisemblance à partir de séquences d'ADN
Télécharger maintenant

SSA Classement & Résumé

SSA Mots clés

moléculaire séquence Séquence d'ADN ADN Analyse moléculaire vraisemblance hiérarchique Modifier les séquences d'ADN Éditeur de séquences d'ADN Analyse de séquences d'ADN Analyser les séquences d'ADN Séquences d'ADN alignées Séquences d'ADN simuler des phylogénies simulation de phylogénie Estimer les grandes phylogénies Grande estimation de phylogénies Analyse de grande phylogénie horloge moléculaire Allèle maximum de vraisemblance

SSA La description

SSA a été développé pour être un programme permettant de déduire une phylogénie de probabilité maximale à partir de séquences d'ADN. Deux versions du programme sont disponibles: une qui suppose une horloge moléculaire et celle qui ne fait pas cette hypothèse. Le procédé de recherche de l'espace des arbres pour l'arborescence ML est basé sur un algorithme de type recuit simulé et est décrit dans la référence ci-dessus. Le programme implémente le modèle de substitution de nucléotides de F84 de Felsenstein et des sous-modèles associés. Le programme estime les longueurs d'arbre et de branche ML et peut éventuellement estimer le rapport transversion / transversion. Lors de la résiliation, le programme renvoie les K arbres de la plus grande vraisemblance trouvés lors de la recherche, où K peut être défini par l'utilisateur.

SSA Logiciels associés