Robin Un préprocesseur de données de microprochance simple à utiliser supportant toutes les plates-formes de micropuce communes
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Robin Classement & Résumé

Robin Mots clés

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Robin La description

Actuellement, plusieurs programmes commerciaux tels que Genespring mettant en vedette une interface utilisateur riche et simple pour analyser statistiquement les micropurs sont disponibles. Cependant, ceux-ci sont généralement très coûteux et peuvent même nécessiter un abonnement annuel D'autre part, il existe des outils libres et open source tels que le bioconducteur offrant une excellente option statistique et un support gratuitement, mais cette puissance est souvent au prix de la convivialité, car ces outils présentent souvent une interface de ligne de commande ou uniquement très bien. Interaction utilisateur de base. Enfin, il existe des outils tels que RMA Express, qui offrent une interface utilisateur riche, mais uniquement un ensemble d'options très limitées. Robin essaie de combler cette lacune en fournissant une interface graphique conviviale flexible pour déclencher la puissance de R / Bioconducteur pour le biologiste individuel. Robin vient comme un fichier installable, qui installe également les cadres R et Bioconducteur. Actuellement, en utilisant Robin, il est possible de normaliser les données de Affymetrix et des données génériques de couleur tabulaires ou de matrices de canal à canal à l'aide d'une gamme de méthodes de normalisation différentes. En outre, Robin propose une variété de méthodes de contrôle de la qualité pouvant être utilisées pour obtenir un aperçu de la qualité et de la structure techniques de données expérimentales. En utilisant le concepteur d'expérimentation graphique intégré, les chercheurs peuvent définir quels échantillons à comparer (même des combinaisons d'échantillons sont possibles) et produisent enfin un ensemble complet de tables et de parcelles donnant des résultats détaillés de l'expérience telle que le changement de vitesse de journal (M), Expression moyenne (a) Valeurs à une probabilité (réglable par l'utilisateur) d'expression différentielle. Tables Résumant des informations sur les 100 gènes réglementés sur les 100 meilleurs et plusieurs parcelles visualisant la qualité de chaque puce sont également générées. Les résultats peuvent directement être importés dans Mapman et Pageman pour la visualisation et une analyse plus approfondie. Robin vous apporte une solution complète pour l'analyse des micro-entreprises et le traitement des données.

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