 | QuasirocombGénérez et analysez des quasispécifiques virales soumis à une recombinaison. |
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Quasirocomb Classement & Résumé
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- Licence:
- Freeware
- Prix:
- Free
- Nom de l'éditeur:
- By Armin Topfer
- Systèmes d'exploitation:
- Windows 2003, Windows 2000, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP
- Exigences supplémentaires:
- Java
- Taille du fichier:
- 8.9 MB
- Téléchargements totaux:
- 30
Quasirocomb Mots clés
Quasirocomb La description
QuasiRecomb est une application légère qui fonctionne dans la console de commande, simulant un modèle de Markov pour générer des quasispécifiques virales. Il décrit la génération des quasispécifiques virales et une méthode permettant de déduire ses paramètres en analysant les données de séquençage de la prochaine génération. Le modèle est validé sur des données simulées, montrant l'avantage de prendre explicitement le processus de recombinaison en compte et testé en appliquant les lectures obtenues à partir d'échantillons expérimentaux de VIH. Il offre une implémentation de l'algorithme EM pour trouver au maximum une estimation postérioriori des paramètres de modèle et une méthode pour estimer la répartition des souches virales dans les quasispecies.
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