Probabilité de synapomorphie

Évaluez la synapomorphie des arbres phylogénétiques à l'aide de cet outil
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Probabilité de synapomorphie Classement & Résumé

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  • Rating:
  • Licence:
  • Freeware
  • Nom de l'éditeur:
  • Martin Turjak
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  • Windows All
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Probabilité de synapomorphie Mots clés


Probabilité de synapomorphie La description

La probabilité de synapomorphie a été conçue comme un script R qui implémente une nouvelle méthode d'évaluation de la synapomorphie sur les arbres phylogénétiques. Tout ce que vous avez à faire est d'installer R et d'exécuter le script. Une méthode qui quantifie le modèle de distribution d'état de caractère sur un cladogramme et en tant que telle est exempte de tout modèle de transformation. La condition est définie pour un état de caractère entièrement synapomorphique comme un état de caractère partagé par tous les taxons terminaux de la clade et en même temps complètement absent de tous les taxons terminaux à l'extérieur de la clade. La mesure dans laquelle cette condition n'est pas violée sert à quantifier la probabilité de synapomorphie. Cette probabilité est calculée en combinant des fréquences d'état de caractère relatif à l'intérieur et à l'extérieur de la clade sur la base de la structure hiérarchique du cladogramme. Il correspond à la probabilité de sélectionner au hasard deux terminaux partageant le même état de caractère dans la clade et diffère en même temps de toutes les bornes extérieures.


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